docs: 补整体框架图与参数系统，交付资料检查改为整例跳过

- 结构.md 第二部分加四段整体框架图；第五部分新增「配置」：每段一份 YAML、
  pydantic 定义、只接收配置路径、编码解码开关与独立映射表
- 结构.md 第三、四部分：检查不过整例跳过，答案库存三表诊断、化名对照、跳过清单
- AGENTS.md「错误怎么处理」加交付资料单例问题的例外。来源：负责人 2026-10-16
  「都是遇到整个病例跳过，让医生核对去吧」
- 待定问题/03 补被跳过病例；WORK_LOG 记决定与下一步

Co-Authored-By: Claude Opus 5.5 <noreply@anthropic.com>

research-wiki/待定问题/03-病例排除标准.md

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 - 旧代码 CEUS 追踪失败 6 例：3 例分屏识别失败，3 例在左半边找不到绿框（其中 1 例已确认造影画面在右半边）。来源：远程 `data/交付包_20260908_40例_result/结果清单_20261016.md`，2026-10-15 读过。
 - 交付说明标明 3 例用肝实质替代正常胰腺作参照、1 例没有参照（`data/交付包_20260908_40例/交付说明_40例_20260908.md`）。
+- 装配两个库时，交付资料检查没过的病例整例跳过，不进资料库（负责人 2026-10-16 定，见 `explanation/结构.md` 第三部分）。已知临床表与超声表对不上的 6 例（`04`）会因此被跳过。医生改正、重新交付后能否补回，和其他排除类别一起定。
 
 ## 为什么要紧