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feat(review): 核对包改成医生读得懂；资料库超声一路只留给 agent 的参数
- ceus：灌注指标改为对病灶去暗区（roi_perf）和紫圈（roi_pan）两组算，roi_all 指标删除；
D1–D4 仍要 roi_all、roi_perf 两条都过才定位（负责人 2026-10-17：医生要正常区与病灶对比看）
- build/library：tic.json 只出两组 11 个指标与 7 个槽位的视频时间；医生截图挪进
ultrasound/keyframes/key.png，UltrasoundRoute 去掉 key_image、keyframes 多一个 key
- review：TIC参数.csv 取代 TIC结果.csv；问题清单按原因对照表写成大白话，对照表外的原因报错；
程序原文进 snapshot/问题清单_原文.csv；说明.pdf 整份重写为合作者口吻
- 文档：结构.md、医生核对包、装配两个库、CEUS定量
任务书 04。
Co-Authored-By: Claude Opus 5.5 <noreply@anthropic.com>
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2026-10-17 10:22:15 -04:00 |
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fix(ceus): 降低长视频内存峰值，快照开跑即写，build 核对 CEUS 运行与交付包
- 内存：prepare_segmentation 改为流式解码，只留分屏和配准的抽样帧，绿框逐帧在两半上找；
分割那一半由 SegmentationInput.target_frames() 到用时再解码，segment_video 边读边写 jpg；
MedSAM2 init_state 的读帧换成直接在存放设备上建张量（不改 MedSAM2 源码，结果逐位相同）；
传播结果写进预分配数组。帧数最多的一段视频常驻内存峰值 11.2 GiB → 2.3 GiB，分辨率最大的
一段原代码被 OOM 杀掉、现为 4.2 GiB；两段的掩码和全部产物与改前逐字节相同，33 段视频的
第 1–2 步结果与改前一致，29 例配准与 review.csv 一致。
- 快照：ceus_quant 开跑时写 snapshot/（git、ceus.yaml、review.csv、uv.lock、segment.json），
配置和核对表从快照副本读；收尾由新函数 runs.finish_snapshot 只新建 finished.json。
build 与 ceus_align_review 同样改用 finish_snapshot 记结束时间。
- build：summary.json 加 video_sha256；装 CEUS 结果时核对快照里的 delivery_dir、逐例核对
视频 SHA-256 和推注时间，不同就整次停下；新字段做类型检查，不进 tic.json。
来源：主会话任务（问题 1–3 及补充的 delivery_dir 比对）。
Co-Authored-By: Claude Opus 5.5 <noreply@anthropic.com>
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2026-10-16 09:01:44 -04:00 |
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feat(ceus): 两半坐标换算改为每段视频配准，加目视核对脚本
- 第 1 步分屏后在两半扇形区内用边缘图归一化互相关估 (dx, dy)，再用逐帧多块模板匹配的中位数独立核对；
两者各分量之差超过门槛（15 像素）这一例第 1 步失败。删掉「两个视图左上角相减」的实现与测试。
- 门槛依据：34 例中走完第 1 步的 29 例，差值中位 2、95 分位 6.2、最大 13；参数与门槛在同一批视频上调出。
- scripts/ceus_align_review.py：只做第 1 步，出扇形区棋盘图与边缘叠加图，混入错开 15–30 像素的
阴性对照、随机编号；计分时任一对照未被判「没对齐」即作废。
- ceus_quant 读 review.csv：不通过的病例第 1 步失败；表里没有这段视频或平移对不上即停。
- 配准与紫圈颜色参数进分割缓存键。
Co-Authored-By: Claude Opus 5.5 <noreply@anthropic.com>
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2026-10-16 06:47:27 -04:00 |
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iomgaa
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feat(ceus,segment): 任务书 02 第二阶段——分割和后半段算法
- ceus 迁入 polygons、dark_region、reference_region、tic_fitting、tic、anchor_frames、
perfusion_metrics、trajectory、tic_curves、tic_plot、overlay，旧测试照搬（改 import 与配置读取）。
- 对外两段接口：prepare_segmentation（第 1–2 步）与 quantify_case（第 4–9 步）。
- 第 3 条：删掉 D1 取医生标注时刻的模式，D1 只从拟合曲线算。
- 第 4 条：F1/F2 取视频第 20−X、60−X 秒（X 为视频第 0 秒时已推注的秒数），落在视频外记未定位。
- 绿框融合权重、紫圈颜色阈值照搬；关键帧容差窗口的出处写进 ceus.yaml 注释。
- segment：同一进程调用 MedSAM2，设置写进 ceus.yaml 的 segment 段，全部必填；gpu 测试真跑通过。
- 依赖加 scipy、matplotlib、medsam2（可编辑安装，不编译 CUDA 扩展）；uv 只解析 linux x86_64。
- 导入契约：只有 segment 引用 torch、sam2；segment 不引用其他 cadx 模块。
Co-Authored-By: Claude Opus 5.5 <noreply@anthropic.com>
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2026-10-16 05:07:02 -04:00 |
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