iomgaa/CADx-4
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iomgaa 7e7f32a13d feat(review): 核对包改成医生读得懂；资料库超声一路只留给 agent 的参数 
- ceus：灌注指标改为对病灶去暗区（roi_perf）和紫圈（roi_pan）两组算，roi_all 指标删除；
  D1–D4 仍要 roi_all、roi_perf 两条都过才定位（负责人 2026-10-17：医生要正常区与病灶对比看）
- build/library：tic.json 只出两组 11 个指标与 7 个槽位的视频时间；医生截图挪进
  ultrasound/keyframes/key.png，UltrasoundRoute 去掉 key_image、keyframes 多一个 key
- review：TIC参数.csv 取代 TIC结果.csv；问题清单按原因对照表写成大白话，对照表外的原因报错；
  程序原文进 snapshot/问题清单_原文.csv；说明.pdf 整份重写为合作者口吻
- 文档：结构.md、医生核对包、装配两个库、CEUS定量

任务书 04。

Co-Authored-By: Claude Opus 5.5 <noreply@anthropic.com>
 2026-10-17 10:22:15 -04:00
iomgaa c7373efde2 feat(review): 医生核对包入口；CEUS 运行目录的读取收进 runs 
- 新模块 review（组织层，只依赖 library、answers、runs）：把一次构建和它装入的
  CEUS 运行整理成医生可读的文件夹（CSV 带 BOM、说明与报告转 PDF、图片视频逐字节拷贝），
  入口 scripts/review_pack.py + config/review_pack.yaml。任务书 03。
- 读 CEUS 运行目录（failed.csv、结果目录、关键帧文件）从 build 挪进 runs，build 与
  review 都经它读；failed.csv 读取在边界上收严（步号须为整数、视频号不重复、列数固定）。
- library、answers 补只读函数；import-linter 增 review 契约。
- 文档：guides/医生核对包.md（过一轮硕士生阅读），结构.md 第三至八部分同步。

Co-Authored-By: Claude Opus 5.5 <noreply@anthropic.com>
 2026-10-17 06:04:19 -04:00
iomgaa 1de88a5d0a fix(ceus): 降低长视频内存峰值，快照开跑即写，build 核对 CEUS 运行与交付包 
- 内存：prepare_segmentation 改为流式解码，只留分屏和配准的抽样帧，绿框逐帧在两半上找；
  分割那一半由 SegmentationInput.target_frames() 到用时再解码，segment_video 边读边写 jpg；
  MedSAM2 init_state 的读帧换成直接在存放设备上建张量（不改 MedSAM2 源码，结果逐位相同）；
  传播结果写进预分配数组。帧数最多的一段视频常驻内存峰值 11.2 GiB → 2.3 GiB，分辨率最大的
  一段原代码被 OOM 杀掉、现为 4.2 GiB；两段的掩码和全部产物与改前逐字节相同，33 段视频的
  第 1–2 步结果与改前一致，29 例配准与 review.csv 一致。
- 快照：ceus_quant 开跑时写 snapshot/（git、ceus.yaml、review.csv、uv.lock、segment.json），
  配置和核对表从快照副本读；收尾由新函数 runs.finish_snapshot 只新建 finished.json。
  build 与 ceus_align_review 同样改用 finish_snapshot 记结束时间。
- build：summary.json 加 video_sha256；装 CEUS 结果时核对快照里的 delivery_dir、逐例核对
  视频 SHA-256 和推注时间，不同就整次停下；新字段做类型检查，不进 tic.json。

来源：主会话任务（问题 1–3 及补充的 delivery_dir 比对）。

Co-Authored-By: Claude Opus 5.5 <noreply@anthropic.com>
 2026-10-16 09:01:44 -04:00
iomgaa 00ebbffb28 feat(ceus): 两半坐标换算改为每段视频配准，加目视核对脚本 
- 第 1 步分屏后在两半扇形区内用边缘图归一化互相关估 (dx, dy)，再用逐帧多块模板匹配的中位数独立核对；
  两者各分量之差超过门槛（15 像素）这一例第 1 步失败。删掉「两个视图左上角相减」的实现与测试。
- 门槛依据：34 例中走完第 1 步的 29 例，差值中位 2、95 分位 6.2、最大 13；参数与门槛在同一批视频上调出。
- scripts/ceus_align_review.py：只做第 1 步，出扇形区棋盘图与边缘叠加图，混入错开 15–30 像素的
  阴性对照、随机编号；计分时任一对照未被判「没对齐」即作废。
- ceus_quant 读 review.csv：不通过的病例第 1 步失败；表里没有这段视频或平移对不上即停。
- 配准与紫圈颜色参数进分割缓存键。

Co-Authored-By: Claude Opus 5.5 <noreply@anthropic.com>
 2026-10-16 06:47:27 -04:00
iomgaa c582fe426f feat(build): 任务书 02 第四阶段代码——build 装入 CEUS 结果 
- build.yaml 加必填字段 ceus_run（CEUS 运行目录或 null）。
- 不为 null 时按视频号找结果；在 failed.csv 里或缺结果目录的整例跳过，记 C15；关键帧图沿用 C14 检查。
- 资料库超声一路加 keyframes/<槽位>.png（去附加数据重编码）和 tic.json（白名单逐字段构造：
  四条曲线的拟合成败与 R²、灌注指标、紫圈曲线是否可用、7 个槽位的定位与视频时间或原因）。
- manifest 的 CEUS 来源写运行号；泄露扫描已覆盖 tic.json，补命中测试。
- 真实构建等配准改完、全量 CEUS 运行之后再做。

Co-Authored-By: Claude Opus 5.5 <noreply@anthropic.com>
 2026-10-16 05:55:57 -04:00
iomgaa 3524b31e3e feat(ceus): 任务书 02 第三阶段——scripts/ceus_quant.py 
- delivery 的 CaseRecord 加视频路径和推注时间（C04、C08 已检查过）。
- scripts/ceus_quant.py：读 ceus.yaml，跑检查全部通过的病例；runs/ceus/<运行号>/ 先写 .partial
  再改名；第 1–6 步的单例失败记 failed.csv 后接着跑；终端只打印计数。
- 分割缓存 work/segment_cache/<键>/：键含视频 SHA-256、第 1–3 步参数、权重 SHA-256、MedSAM2 提交号。
- 视频解码错误改为第 1 步的单例失败（VideoDecodeError），不再停掉整次运行（审阅意见）。
- 暗区 kmeans 用 cv2 进程级随机数，结果受病例顺序影响；ceus 配置加必填 random_seed，每例第 4 步前设种子。
- segment 导出 cuda_peak_memory_bytes，供运行快照记录显存峰值。

Co-Authored-By: Claude Opus 5.5 <noreply@anthropic.com>
 2026-10-16 05:30:29 -04:00