Commit Graph

2 Commits

Author SHA1 Message Date
iomgaa 1de88a5d0a fix(ceus): 降低长视频内存峰值,快照开跑即写,build 核对 CEUS 运行与交付包
- 内存:prepare_segmentation 改为流式解码,只留分屏和配准的抽样帧,绿框逐帧在两半上找;
  分割那一半由 SegmentationInput.target_frames() 到用时再解码,segment_video 边读边写 jpg;
  MedSAM2 init_state 的读帧换成直接在存放设备上建张量(不改 MedSAM2 源码,结果逐位相同);
  传播结果写进预分配数组。帧数最多的一段视频常驻内存峰值 11.2 GiB → 2.3 GiB,分辨率最大的
  一段原代码被 OOM 杀掉、现为 4.2 GiB;两段的掩码和全部产物与改前逐字节相同,33 段视频的
  第 1–2 步结果与改前一致,29 例配准与 review.csv 一致。
- 快照:ceus_quant 开跑时写 snapshot/(git、ceus.yaml、review.csv、uv.lock、segment.json),
  配置和核对表从快照副本读;收尾由新函数 runs.finish_snapshot 只新建 finished.json。
  build 与 ceus_align_review 同样改用 finish_snapshot 记结束时间。
- build:summary.json 加 video_sha256;装 CEUS 结果时核对快照里的 delivery_dir、逐例核对
  视频 SHA-256 和推注时间,不同就整次停下;新字段做类型检查,不进 tic.json。

来源:主会话任务(问题 1–3 及补充的 delivery_dir 比对)。

Co-Authored-By: Claude Opus 5.5 <noreply@anthropic.com>
2026-10-16 09:01:44 -04:00
iomgaa 150eb5f6ae feat(ceus,segment): 任务书 02 第二阶段——分割和后半段算法
- ceus 迁入 polygons、dark_region、reference_region、tic_fitting、tic、anchor_frames、
  perfusion_metrics、trajectory、tic_curves、tic_plot、overlay,旧测试照搬(改 import 与配置读取)。
- 对外两段接口:prepare_segmentation(第 1–2 步)与 quantify_case(第 4–9 步)。
- 第 3 条:删掉 D1 取医生标注时刻的模式,D1 只从拟合曲线算。
- 第 4 条:F1/F2 取视频第 20−X、60−X 秒(X 为视频第 0 秒时已推注的秒数),落在视频外记未定位。
- 绿框融合权重、紫圈颜色阈值照搬;关键帧容差窗口的出处写进 ceus.yaml 注释。
- segment:同一进程调用 MedSAM2,设置写进 ceus.yaml 的 segment 段,全部必填;gpu 测试真跑通过。
- 依赖加 scipy、matplotlib、medsam2(可编辑安装,不编译 CUDA 扩展);uv 只解析 linux x86_64。
- 导入契约:只有 segment 引用 torch、sam2;segment 不引用其他 cadx 模块。

Co-Authored-By: Claude Opus 5.5 <noreply@anthropic.com>
2026-10-16 05:07:02 -04:00