fix: add close/context-manager to diagnosis store; tighten import boundary

core/evolution/protocols.py

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-"""core/evolution/ 子包的只读 Protocol 定义。
+"""core/evolution/ 子包的持久化 Protocol 定义。
 
-三个 Protocol 均为只读——core/ 返回结果 dataclass，写入由 app/ 持久化。
-SkillStore / PromptStore 为同步（文件读取量小且快），RunLog 为异步
-（隔离 SQLite 查询，core/ 不写 SQL）。
+SkillStore / PromptStore / RunLog 为只读——core/ 返回结果 dataclass，
+读取由 app/ 落盘的资源。SkillStore / PromptStore 同步（文件读取量小且快），
+RunLog 异步（隔离 SQLite 查询，core/ 不写 SQL）。
+DiagnosisSignalStore 兼具读写：逐题 upsert 诊断信号并支持断点续跑查询，
+同样隔离 SQLite 实现，app/core 不写裸 SQL。
 """
 
 from __future__ import annotations