chore: track claude skills, tools, templates, reference code and research-wiki

- Add all claude skills (brainstorming, commit, debugging, TDD, etc.)
- Add claude hooks (pre-commit-guard, post-edit-quality)
- Add research templates (experiment plan, research brief, etc.)
- Add claude tools (arxiv/semantic_scholar/openalex fetch, wiki, exa)
- Add TRM4 reference implementation as algorithm fidelity baseline
- Add research-wiki content (plans, index, graph, query_pack)
- Update .gitignore to exclude .graphify_version runtime state
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2026-07-06 20:59:03 -04:00
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"""
嵌入服务模块
============
封装文本嵌入器,支持本地 sentence-transformers 和远程 OpenAI 兼容 API 两种后端。
提供统一的 ``embed()`` / ``embed_tensor()`` 接口,冻结不训练。
使用方式::
from video_tree_trm.embeddings import EmbeddingModel
from video_tree_trm.config import Config
cfg = Config.load("config/default.yaml")
model = EmbeddingModel(cfg.embed)
vecs = model.embed(["你好世界"]) # ndarray [1, D]
tens = model.embed_tensor(["你好"]) # Tensor [1, D]
"""
from __future__ import annotations
from typing import List, Union
import numpy as np
import torch
from numpy import ndarray
from torch import Tensor
from utils.logger_system import ensure, log_msg
from video_tree_trm.config import EmbedConfig
class EmbeddingModel:
"""文本嵌入器封装(冻结),支持本地和远程双后端。
本地模式: 使用 sentence-transformers 加载 HuggingFace 模型,本地推理。
远程模式: 调用 OpenAI 兼容 API(如 GPUStack 上的 qwen3-embedding)。
属性:
dim: 嵌入维度 D。
"""
def __init__(self, config: EmbedConfig) -> None:
"""初始化嵌入模型。
参数:
config: 嵌入配置,包含 backend、model_name、embed_dim 等。
异常:
ValueError: backend 不是 "local""remote"
ValueError: 远程模式缺少 api_key 或 api_url。
"""
ensure(
config.backend in ("local", "remote"),
f"embed.backend 必须为 'local''remote',实际为 '{config.backend}'",
)
self._backend = config.backend
self._dim = config.embed_dim
if self._backend == "local":
self._init_local(config)
else:
self._init_remote(config)
log_msg(
"INFO", "嵌入模型初始化完成", backend=self._backend, model=config.model_name
)
# ------------------------------------------------------------------
# 初始化
# ------------------------------------------------------------------
def _init_local(self, config: EmbedConfig) -> None:
"""初始化本地 sentence-transformers 模型。
参数:
config: 嵌入配置。
"""
from sentence_transformers import SentenceTransformer
self._model = SentenceTransformer(config.model_name, device=config.device)
self._model.eval()
# 冻结所有参数
for param in self._model.parameters():
param.requires_grad = False
actual_dim = self._model.get_sentence_embedding_dimension()
ensure(
actual_dim == self._dim,
f"模型实际维度 ({actual_dim}) 与配置 embed_dim ({self._dim}) 不一致",
)
def _init_remote(self, config: EmbedConfig) -> None:
"""初始化远程 OpenAI 兼容 API 客户端。
参数:
config: 嵌入配置。
"""
ensure(bool(config.api_key), "远程模式必须提供 embed.api_key")
ensure(bool(config.api_url), "远程模式必须提供 embed.api_url")
from openai import OpenAI
self._client = OpenAI(base_url=config.api_url, api_key=config.api_key)
self._model_name = config.model_name
# ------------------------------------------------------------------
# 公共接口
# ------------------------------------------------------------------
@property
def dim(self) -> int:
"""嵌入维度 D。"""
return self._dim
def embed(self, texts: Union[str, List[str]]) -> ndarray:
"""文本 → 嵌入向量(L2 归一化)。
参数:
texts: 单条文本或文本列表。
返回:
[N, D] ndarray,每行 L2 范数为 1.0。单条文本时 N=1。
"""
if isinstance(texts, str):
texts = [texts]
if self._backend == "local":
return self._embed_local(texts)
return self._embed_remote(texts)
def embed_tensor(self, texts: Union[str, List[str]]) -> Tensor:
"""文本 → 嵌入 Tensor(L2 归一化)。
参数:
texts: 单条文本或文本列表。
返回:
[N, D] torch.Tensorfloat32)。
"""
arr = self.embed(texts)
return torch.from_numpy(arr).float()
# ------------------------------------------------------------------
# 后端实现
# ------------------------------------------------------------------
def _embed_local(self, texts: List[str]) -> ndarray:
"""本地 sentence-transformers 推理。
参数:
texts: 文本列表。
返回:
[N, D] ndarrayL2 归一化。
"""
with torch.no_grad():
embeddings = self._model.encode(
texts,
normalize_embeddings=True,
convert_to_numpy=True,
)
# sentence-transformers encode 返回 ndarray [N, D]
if embeddings.ndim == 1:
embeddings = embeddings.reshape(1, -1)
return embeddings
def _embed_remote(self, texts: List[str]) -> ndarray:
"""远程 OpenAI 兼容 API 调用。
参数:
texts: 文本列表。
返回:
[N, D] ndarrayL2 归一化。
"""
response = self._client.embeddings.create(
model=self._model_name,
input=texts,
)
# 按 index 排序,确保顺序一致
sorted_data = sorted(response.data, key=lambda x: x.index)
embeddings = np.array(
[item.embedding for item in sorted_data], dtype=np.float32
)
# L2 归一化
norms = np.linalg.norm(embeddings, axis=1, keepdims=True)
norms = np.maximum(norms, 1e-12) # 避免除零
embeddings = embeddings / norms
return embeddings