 iomgaa
|
00ebbffb28
|
feat(ceus): 两半坐标换算改为每段视频配准，加目视核对脚本
- 第 1 步分屏后在两半扇形区内用边缘图归一化互相关估 (dx, dy)，再用逐帧多块模板匹配的中位数独立核对；
两者各分量之差超过门槛（15 像素）这一例第 1 步失败。删掉「两个视图左上角相减」的实现与测试。
- 门槛依据：34 例中走完第 1 步的 29 例，差值中位 2、95 分位 6.2、最大 13；参数与门槛在同一批视频上调出。
- scripts/ceus_align_review.py：只做第 1 步，出扇形区棋盘图与边缘叠加图，混入错开 15–30 像素的
阴性对照、随机编号；计分时任一对照未被判「没对齐」即作废。
- ceus_quant 读 review.csv：不通过的病例第 1 步失败；表里没有这段视频或平移对不上即停。
- 配准与紫圈颜色参数进分割缓存键。
Co-Authored-By: Claude Opus 5.5 <noreply@anthropic.com>
|
2026-10-16 06:47:27 -04:00 |
|
|
iomgaa
|
3524b31e3e
|
feat(ceus): 任务书 02 第三阶段——scripts/ceus_quant.py
- delivery 的 CaseRecord 加视频路径和推注时间（C04、C08 已检查过）。
- scripts/ceus_quant.py：读 ceus.yaml，跑检查全部通过的病例；runs/ceus/<运行号>/ 先写 .partial
再改名；第 1–6 步的单例失败记 failed.csv 后接着跑；终端只打印计数。
- 分割缓存 work/segment_cache/<键>/：键含视频 SHA-256、第 1–3 步参数、权重 SHA-256、MedSAM2 提交号。
- 视频解码错误改为第 1 步的单例失败（VideoDecodeError），不再停掉整次运行（审阅意见）。
- 暗区 kmeans 用 cv2 进程级随机数，结果受病例顺序影响；ceus 配置加必填 random_seed，每例第 4 步前设种子。
- segment 导出 cuda_peak_memory_bytes，供运行快照记录显存峰值。
Co-Authored-By: Claude Opus 5.5 <noreply@anthropic.com>
|
2026-10-16 05:30:29 -04:00 |
|
|
iomgaa
|
150eb5f6ae
|
feat(ceus,segment): 任务书 02 第二阶段——分割和后半段算法
- ceus 迁入 polygons、dark_region、reference_region、tic_fitting、tic、anchor_frames、
perfusion_metrics、trajectory、tic_curves、tic_plot、overlay，旧测试照搬（改 import 与配置读取）。
- 对外两段接口：prepare_segmentation（第 1–2 步）与 quantify_case（第 4–9 步）。
- 第 3 条：删掉 D1 取医生标注时刻的模式，D1 只从拟合曲线算。
- 第 4 条：F1/F2 取视频第 20−X、60−X 秒（X 为视频第 0 秒时已推注的秒数），落在视频外记未定位。
- 绿框融合权重、紫圈颜色阈值照搬；关键帧容差窗口的出处写进 ceus.yaml 注释。
- segment：同一进程调用 MedSAM2，设置写进 ceus.yaml 的 segment 段，全部必填；gpu 测试真跑通过。
- 依赖加 scipy、matplotlib、medsam2（可编辑安装，不编译 CUDA 扩展）；uv 只解析 linux x86_64。
- 导入契约：只有 segment 引用 torch、sam2；segment 不引用其他 cadx 模块。
Co-Authored-By: Claude Opus 5.5 <noreply@anthropic.com>
|
2026-10-16 05:07:02 -04:00 |
|
|
iomgaa
|
9a916c65a5
|
feat(ceus): 任务书 02 第一阶段——底层和分割之前的算法；修复 C14
任务书 01 遗留修复（C14）：
- library 新增 check_key_image(path)：关键图能逐像素保真重编码时返回 None，否则返回原因；
_write_clean_png 的判断移过去，自身保留断言性质报错（走到这里说明 build 漏了检查）。
- build 写库前对每例调用，返回原因的整例跳过，记 C14「关键图能原样重编码」，涉及值写原因。
- 原来三条「关键图格式不对整次构建停下」的测试改为整例跳过，另加非 PNG、library 漏检报错两条。
- 结构.md 第八部分、guides/装配两个库.md 相应几行改掉。
第一阶段（src/cadx/ceus/）：
- 照搬旧 geometry、video_decoder、research_config、split_screen、green_prompt、prompt_frames、
mapping，去掉产品层，注释改中文。
- 配置类去掉全部默认值，strict、extra=forbid、frozen；新建 config/ceus.yaml（paths、ceus 两段），
数值照抄旧 yaml，逐项注明出处。删去 source_view/target_view、effective_region、mapping 锚点；
旧代码写死的分屏抽帧数 25 和搜索区间 (0.35, 0.65) 改成配置，值不变。
- 视频解码改为按路径用 cv2 逐帧读。
- 坐标换算改为两个视图矩形左上角之差，不再用按某种宽度写死的锚点。
- 造影画面在哪一半：两半各自选提示帧，恰好一半有才定，否则抛 ContrastSideError（CeusCaseError
子类，带步号和原因，供第三阶段记 failed.csv）。
- 旧测试照搬（改 import 与配置读取方式），因上述改动不再成立的删去；新增两处修改的手算测试。
- import-linter 加「ceus 不引用其他 cadx 模块」。依赖加 numpy、opencv-python-headless。
Co-Authored-By: Claude Opus 5.5 <noreply@anthropic.com>
|
2026-10-16 03:46:56 -04:00 |
|