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从产品重构为研究原型的第一步（负责人 2026-10-15：「其其实不需要（至少目前不需要） 是一个工程产品」）。协作环境照 ClinDB-ReviewBench（负责人点名参考）。 - AGENTS.md 为唯一规则，CLAUDE.md 只引用它；硬性约束保留旧项目的答案隔离、各路隔离， 加上数字可追溯、花钱先报预估等 - WORK_LOG.md 记当前状态与负责人的关键决定 - research-wiki：README、explanation/结构.md（8 个模块、依赖边界、推进顺序）、 design/0001（为什么重构、继承与放弃什么、单一 uv 环境）、guides/开发环境.md - 三份新文档过了一轮「硕士生阅读」并按意见修订 Co-Authored-By: Claude Opus 5.5 <noreply@anthropic.com>
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research-wiki
本项目的文档。读者是没参与过讨论的医学 AI 方向硕士生：懂 Python 和深度学习，不懂胰腺囊性肿瘤。
| 位置 | 内容 | 维护方式 |
|---|---|---|
explanation/ |
系统由哪些环节组成、各环节的输入输出、为什么这样分。从 结构.md 读起 |
常青：改了就重写那一段 |
design/ |
每次重要决策的来历，文件名 NNNN-简短主题.md |
写完冻结；决策变了新写一份并注明取代关系 |
guides/ |
怎么做某件事：建环境、跑某个环节 | 常青，随实际情况更新 |
reference/ |
查得到的外部事实：术语表、算法参数的原始口径、临床方给的字段定义。每条自带出处；抄自 Linear 的写明抄自哪份、哪天同步 | 常青，随出处更新 |
任务书/ |
每个模块动手前的任务书，文件名 NN-模块名.md：要做什么、依据哪些文档、怎么验收 |
负责人确认后交执行者；要改就在开头写「这一版改了什么」 |
survey/ |
文献调研：同类工作怎么做、对我们意味着什么，引文带 PDF 页码（PDF 在根目录 reference-pdf/，不进 git） |
写完冻结；有新调研另写一份 |
results/ |
实验结果报告，每个数字标明来自哪次运行（runs/ 下的目录名） |
写完冻结 |
scratch/ |
讨论中的草稿、上下文压缩前的快照 | 由负责人清理，Agent 不删 |
几类文档的开头
不用 YAML 头，靠固定的开头段落：
- design：
# NNNN 标题→状态：负责人 YYYY-MM-DD 认可（「原话」） ｜ 日期：…→ 取代了谁就写一行> 取代 NNNN 的第 X 条→## 先认识几个词→## 背景→## 决定（编号条目，写明哪条是负责人定的、哪条是 Agent 提的） → 需要时加## 不做的事。 - 任务书：标题 → 一段目的 →
来源：（负责人原话） →## 先认识几个词→## 开工前先读→ 分阶段的工作内容（每阶段写收尾点） →## 测试→## 规模→## 审阅→## 报告（分开写已验证的事实、推断和未验证的部分，附运行目录、提交号、花费）。 - results：
日期 ｜ 对应结构.md 第六节第 N 步 ｜ 原始记录：runs/…→## 先认识几个词→## 一 跑了什么→ 结果，每个数字带运行目录。