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CADx-4/WORK_LOG.md
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iomgaa 9b2f842559 docs: 架构定稿——四段流水线、两个库与待定问题
负责人 2026-10-16 定:数据流为「医院原始资料->中间文件->给专家的资料库 & 标准答案库」;
两个库和中间文件都用文件夹,SQLite 只用于调模型账本;调模型用 PolyGateway;CEUS 直接逐个
迁移;数据格式和口径以 40 例交付包为准。存储与迁移方案先由两个中立子 Agent 独立评审。

- design 0002:八条决定及负责人原话(化名与打乱顺序一条为 Agent 提出)
- explanation/结构.md 对照 ClinDB 的结构文档重写:切分原则、完整范围、12 个模块与依赖、
  边界、两个库与 CEUS 中间文件的内容、目录与检查、规模、推进顺序
- research-wiki/待定问题/:绿框、参数冻结、排除标准、跨表不一致四个问题;定了就删
- AGENTS.md:事实来源加「交付资料的格式和口径以最新交付包为准」
- .gitignore 与 pre-commit 拦截 library/、answers/、work/

Co-Authored-By: Claude Opus 5.5 <noreply@anthropic.com>
2026-10-16 00:44:42 -04:00

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# 工作记录
只记当前状态。一个阶段完成后压缩成几行,细节看提交说明和 `research-wiki/`。
## 当前目标
骨架已完成;整体架构已和负责人讨论定稿(`research-wiki/design/0002`、`explanation/结构.md`)。下一步是写第 2 步「资料整理(不含 CEUS)」或第 3 步「CEUS 定量」的任务书。
## 已完成
- 2026-10-15 盘点旧项目(远程 `CADx-4-CAD`)与两个参考项目(ClinDB-ReviewBench、dissect3),结论写进 `research-wiki/design/0001-从产品重构为研究原型.md`。
- 2026-10-15 旧项目复制到 `reference/CADx-4-CAD/`:工作区(含没进 git 的 `debugs/t1_local_debug.py`、`debugs/medsam2_local_track.py` 和 `tic_lognormal_replay.py` 的未提交改动)加 `git fetch` 恢复的 366 个提交、5 个远程分支。
- 2026-10-15 `data/` 同步完成:`交付包_20260908_40例`(124 个文件)、`1.2-TEST`(1460 个文件),文件数与文件总字节数(4,034,244,118)和远程一致。
- 2026-10-15 骨架(三份新文档过了一轮「硕士生阅读」并按意见修订):`AGENTS.md`、`CLAUDE.md`、`research-wiki/` 目录与 `README.md`、`explanation/结构.md`、`design/0001`、`guides/开发环境.md`;uv 工具链、`make sync/fmt/test/check`、pre-commit。`make check` 通过(1 项测试、1 条导入契约)。提交 5eb38df(工具链)、1f7a6a3(文档)。
- 2026-10-15/16 深读旧项目三条线(CEUS 算法、资料与答案隔离、会诊与评价),两位中立评审独立评了存储与迁移方案;结论落成 design 0002 与重写的 `结构.md`。待定的研究问题记在 `research-wiki/待定问题/`。
## 未完成
- `结构.md` 按负责人要求对照 ClinDB 的 `结构.md` 重写后,重写版还没再过一轮「硕士生阅读」(design 0002 与上一版结构文档过过)。
## 关键决定
- 负责人 2026-10-15「其其实不需要(至少目前不需要)是一个工程产品」:按研究原型重写,产品层不迁移(design 0001)。
- 负责人 2026-10-15 选定:检查强度「ClinDB 级」(不要提交审查闸);注释和 docstring 用中文;本机为主(「目前以本地为主,以后会根据具体情况调整」)。
- 负责人 2026-10-15 同意:MedSAM2 与 torch 装在同一个 uv 环境,靠导入边界隔离,不单独开环境(design 0001 第 7 条)。
- 负责人 2026-10-16:调模型用 PolyGateway;两个库和中间文件都用文件夹(SQLite 只用于调模型账本);CEUS「直接一个个迁移」,不在本机重跑旧代码作基线;数据格式和口径以 40 例交付包为准,「推注开始时间s」是视频第 0 秒时已推注的秒数(design 0002)。
## 下一步
- 和负责人定先做第 2 步还是第 3 步,再写对应任务书;动手前先讲旧代码的结构与打算。
- 把 `待定问题/04`(6 例跨表不一致)转给医生。
- 等临床方交付 40 例的医生标注工作簿(含造影剂到达时间和注射时间)。