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iomgaa de1d6b2d51 docs: 任务书 02 CEUS 定量；待定问题 07、08；CEUS 运行产物改放 runs/ceus/

- 任务书 02：先修 C14（关键图问题改为跳过单例）；四阶段迁移 ceus、segment、
  ceus_quant、build 装入 8 张图中的 7 张关键帧与 tic.json；过一轮「硕士生阅读」
- 负责人 2026-10-16：MedSAM2 从远程拷贝最快；任务书一份；紫圈阈值先照搬并记待定问题；
  CEUS 整例失败跳过、拟合不过只缺 D1–D4，两点认可
- 待定问题 07（超声图上烧录的性别年龄）、08（紫圈颜色阈值是占位值）
- 结构.md：CEUS 运行产物进 runs/ceus/（会进资料库与论文，需可追溯），work/ 只放分割缓存

Co-Authored-By: Claude Opus 5.5 <noreply@anthropic.com>

2026-10-16 03:24:01 -04:00

4.9 KiB

Raw Blame History

工作记录

只记当前状态。一个阶段完成后压缩成几行，细节看提交说明和 research-wiki/。

当前目标

第 2 步「装配两个库（不含 CEUS）」已按任务书 01 实现，等监督者验收。之后是第 3 步 CEUS 定量或会诊口径讨论（结构.md 第七部分）。

已完成

2026-10-15 盘点旧项目（远程 CADx-4-CAD）与两个参考项目（ClinDB-ReviewBench、dissect3），结论写进 research-wiki/design/0001-从产品重构为研究原型.md。
2026-10-15 旧项目复制到 reference/CADx-4-CAD/：工作区（含没进 git 的 debugs/t1_local_debug.py、debugs/medsam2_local_track.py 和 tic_lognormal_replay.py 的未提交改动）加 git fetch 恢复的 366 个提交、5 个远程分支。
2026-10-15 data/ 同步完成：交付包_20260908_40例（124 个文件）、1.2-TEST（1460 个文件），文件数与文件总字节数（4,034,244,118）和远程一致。
2026-10-15 骨架（三份新文档过了一轮「硕士生阅读」并按意见修订）：AGENTS.md、CLAUDE.md、research-wiki/ 目录与 README.md、explanation/结构.md、design/0001、guides/开发环境.md；uv 工具链、make sync/fmt/test/check、pre-commit。make check 通过（1 项测试、1 条导入契约）。提交 5eb38df（工具链）、1f7a6a3（文档）。
2026-10-15/16 深读旧项目三条线（CEUS 算法、资料与答案隔离、会诊与评价），两位中立评审独立评了存储与迁移方案；结论落成 design 0002 与重写的 结构.md。待定的研究问题记在 research-wiki/待定问题/。
2026-10-16 任务书 01 装配两个库：delivery、library、answers、runs（快照）、build 五个模块，scripts/build.py、scripts/scan_library.py、config/build.yaml，91 条测试，make check 通过（6 条导入契约）。两轮独立审阅的会悄悄漏答案的意见已修（C11–C13 加严、泄露扫描 NFKC、关键图只收能保真重编码的 PNG、YAML 拒绝重复键）。真实 40 例：40 例中 34 例进库，跳过 6 例全为 C10（跨表不一致，与 待定问题/04 一致），复核清单 2 条，泄露扫描命中 0；构建号与提交号见提交说明和本次汇报。使用说明 guides/装配两个库.md。

未完成

2026-10-16 任务书 01 由执行者完成（提交 bceb01e），监督者验收通过：真实 40 例进库 34、跳过 6（C10 跨表不一致），独立脚本核对资料库内容与跳过名单一致，泄露扫描 0 命中。
结构.md 按负责人要求对照 ClinDB 的 结构.md 重写后，重写版还没再过一轮「硕士生阅读」（design 0002 与上一版结构文档过过）。

关键决定

负责人 2026-10-15「其其实不需要（至少目前不需要）是一个工程产品」：按研究原型重写，产品层不迁移（design 0001）。
负责人 2026-10-15 选定：检查强度「ClinDB 级」（不要提交审查闸）；注释和 docstring 用中文；本机为主（「目前以本地为主，以后会根据具体情况调整」）。
负责人 2026-10-15 同意：MedSAM2 与 torch 装在同一个 uv 环境，靠导入边界隔离，不单独开环境（design 0001 第 7 条）。
负责人 2026-10-16：调模型用 PolyGateway；两个库和中间文件都用文件夹（SQLite 只用于调模型账本）；CEUS「直接一个个迁移」，不在本机重跑旧代码作基线；数据格式和口径以 40 例交付包为准，「推注开始时间s」是视频第 0 秒时已推注的秒数（design 0002）。
负责人 2026-10-16：先做第 2 步装配两个库；配置每段一份（config/<段>.yaml），编码解码是可选开关、映射表单独一份配置；交付资料检查一例有一项不过就整例跳过并记录，「都是遇到整个病例跳过，让医生核对去吧」；化名对照存进答案库。已写进 结构.md（框架图、第五部分「配置」）和 AGENTS.md「错误怎么处理」。
负责人 2026-10-16 定 C04：报告表名随视频名配对（U<号>_roi2.mp4 配 U<号>_roi2_report.xlsx，U<号>.mp4 配 U<号>_report.xlsx），绿框版那一例因此进库。任务书 01 原文只认前一种，未改任务书。

下一步

监督者验收任务书 01。
待负责人定：关键图格式不合要求时整次停下还是整例跳过；化名种子在 git 里，拿到种子可反推进库病例的病例号先后（专家拿不到种子）；含「造影提示：」的那份超声描述所在病例被 C10 跳过，故不在复核清单里。
向临床方要编码映射表（性别、诊断、症状、既往史、化验档位）。
把 待定问题/04（6 例跨表不一致）、待定问题/06（1 份超声描述中段的「造影提示：」）转给医生；06 定之前的构建不做正式会诊。
等临床方交付 40 例的医生标注工作簿（含造影剂到达时间和注射时间）。

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